迷你鹦鹉鱼是可以自然繁殖的,一般在2-3月龄时就会出现性成熟的个体。雌雄亲鱼的辨别比较容易:1、雄鱼腹部膨大,泄殖孔周围鳞片松散;雌鱼腹部平坦,泄殖孔周围鳞片紧密。2、雄鱼背鳍和臀鳍后缘有蓝色边线,尾柄基部上方有红色斑块;雌鱼无此特征。
繁殖水温应保持在26-28摄氏度之间,水质要求澄清。迷你鹦鹉鱼为卵胎生鱼类,繁殖比较困难,要经过4个阶段:第一阶段雌鱼腹部逐渐膨大,颜色也变得鲜艳起来,这表明已经进入繁殖期。第二阶段是雄鱼开始追逐雌鱼,进行求爱。第三阶段是雄鱼排精,雌鱼产仔。